第1351章 新生们都很忙(上)(1/2)
开学第二周。
实验室的灯从来没关过。
白板上已经被擦过无数次,每次擦完又密密麻麻写满新的批注。
现在上面并列画着三组流程图——肝癌三联方案的靶向性验证、代谢编辑的体外细胞系测试、PD-L1脱靶评估的蒙特卡洛模拟参数调整。
每一组流程图工整,一笔一划跟高考答题卡似的。优素福的签名全是阿语,但旁边会贴心地画个箭头标注英文缩写。
凌晨两点。
赵一舟从PCR仪里取出最后一批扩增产物,把96孔板端到凝胶电泳槽旁边。
动作轻得跟端着一碗刚出锅的豆腐脑一样——优素福趴在旁边的实验台上睡着了,脸枕在手臂上,手边还摊着一本烧了一半的微生物学教材。书页翻到第七章,空白处密密麻麻写满了阿语批注。
“一舟,你那个条带跑出来了吗?”
陈述从细胞房探出头,手套上还沾着培养基。
“跑出来了,PKM2剪接位点的扩增效率跟预测值完全吻合。但引物二聚体有点多,需要重新优化退火温度。”
“降两度试试。”
“已经试过了,五十二度降到五十度,二聚体少了但特异性也降了。我觉得不是温度的问题,是镁离子浓度。现有配方是英格丽德从数据库里调的标准方案,但那个方案是针对欧洲人群样本优化的,亚洲人群的GC含量高一些,需要的镁离子浓度可能也要调。”
陈述把手套摘了扔进废液桶,走到电泳槽旁边蹲下来,盯着紫外透射仪上的条带看了足足半分钟。
“你说得对。亚洲人群的等位基因频率分布跟欧洲不一样,GC含量偏高,标准方案的扩增条件不是最优的。明天让英格丽德重新跑一个镁离子梯度测试,把亚洲人群作为一个独立变量加进蒙特卡洛模型里。”
“优素福呢?”
“非洲人群的验证跑完了吗?”
优素福不知道什么时候醒了,从手臂上抬起头,脸上压出一道红印子。揉了揉眼睛,把笔记本电脑翻开,屏幕上是一组刚出炉的Sanger测序峰图。
“跑完了,数据在我电脑里。非洲人群那个SNP位点的等位基因频率比欧洲高出将近一倍。我们之前设计的那条sgRNA正好覆盖了这个位点,如果不调整序列,在非洲人群里的编辑效率会打折扣。”
“那怎么办?”
“我重新设计了几条备选sgRNA,避开了SNP位点,同时保持了靶向特异性。序列文件已经发给安德斯了,等他明天上机测试。”
陈述看了优素福一眼。
“你什么时候醒的?”
“你刚才说‘镁离子浓度可能也要调’的时候,我半梦半醒听到这句话,脑子自动开始查数据库——非洲人群的GC含量比亚洲还高,所以镁离子的问题在我们那边更严重。等英格丽德跑完梯度测试,我同步套一个非洲人群的平行验证。”
赵一舟把移液枪放回架子上,往椅背上一靠。
“我突然想到一个问题,我们这个三联方案,目前的设计是基于亚洲、欧洲、非洲三个人群的等位基因频率做的。但拉美人群呢?大洋洲原住民呢?”
“你说得对,如果这套方案将来要推广到全球,就得覆盖所有主要人群的遗传背景。但我们现在人手不够。德国来的那个博士生在跑类器官培养,山田在调蒙特卡洛模拟的参数,陈述的同学在跑伦理补充材料的修改稿。拉美人群的数据得有人去挖。”
“找谁?”
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